Передано ФГБОУ ВО «Государственный университет морского и речного флота имени адмирала С.О. Макарова», образованным после объединения Государственной морской академии имени адмирала C.О. Макарова и Санкт-Петербургского университета водных коммуникаций в 2012 году.

История вузов, образовавших ГУМРФ началась 2 декабря 1809 года, когда Манифестом Александра I Департамент водяных коммуникаций и Экспедиция устроения дорог в государстве были преобразованы в Управление водяными и сухопутными сообщениями и создан Корпус инженеров путей сообщения. В новом институте преподавали французские инженеры-проектировщики транспортных коммуникаций П. Базен, А. Фабр, К. Потье, А. Дестрем. В 1930 г. Институт инженеров путей сообщения был реорганизован в отраслевые учебные заведения, и 1 апреля 1930 года был создан Ленинградский институт инженеров водного транспорта, готовивший специалистов на трёх факультетах: гидротехнический, механический и эксплуатационный. В 1959 году вуз был объединён с Центральным научно-исследовательским институтом речного флота.

7 мая 1876 года Указом Императора Александра II были образованы мореходные классы Санкт-Петербургского речного яхт-клуба, положившие начало Государственной морской академии. 6 мая 1902 года Николай II учредил на базе мореходных классов училище дальнего плавания. С 1905 года помимо судоводителей училище стало готовить судомехаников. С 1949 года учебное заведение несёт имя адмирала Степана Макарова. После объединения с Высшим морским арктическим училищем было образовано Ленинградское высшее инженерное морское училище имени адмирала С. О. Макарова, получившее в 1990 году статус академии. 25 октября 2013 года в составе ГУМРФ был образован институт «Морская академия», где сконцентрированы все эксплуатационные специальности, на которых обучаются курсанты университета.

Образовательная деятельность университета направлена на подготовку высококвалифицированных кадров для транспортной инфраструктуры России. Процесс обучения в Университете ведется в соответствии с Государственными образовательными стандартами, а по морским направлениям образования, учитываются требования Международной конвенции о подготовке и дипломировании моряков и несении вахты. Все выпускники Университета после окончания учебного заведения получают диплом о высшем образовании государственного образца. На период обучения всем иногородним студентам предоставляются места в общежитии. Курсанты, обучающиеся на плавательных специальностях, находятся на полном государственном обеспечении. Им гарантируется бесплатное проживание в общежитии, трехразовое питание, форменная одежда. Всем студентам и курсантам Университета на время обучения предоставляется отсрочка от армии.